1、军机处职能原为承名拟旨，参与军务 ， 后逐渐演变为全国政令的策源地和行政中心，其地位远远高于作为国家行政中枢的内阁 。
2、军机处职掌着每日晋见皇帝，共商处理军国大事 ， 并奉旨对各部门各地方负责官员发布指示的重要使命 。
3、根据内阁制度，下属官员有事题奏，或皇帝颁发诏旨，都是经过层层机构，辗转交送 。军机处则不然，一切均由大臣和章京通同办理，皇帝有谕 ， 随时奉诏承办，而且必须当日事当日毕 。
【清朝军机处设立的特点】4、军机处实行了严格的归档保密规定，还设有专门的档案房 ， 有专职的保密人员管理档案，为后代留下了许多难得的珍贵史料 。
5、集权专制，军机处行走大臣也只是跪受笔录并无实际权力 。

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