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![怎么把图片导入excel 如何把图片导入excel](http://img.hubeilong.com/220623/0242021492-0.jpg)
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Excel进行配色提取 , 绘制Cell都在用的南丁格尔玫瑰图、GO富集图等!
一位审稿人曾经说:“我看稿件的顺序是题目、摘要、图表、前言、参考文献和正文 。”
可见论文图片质量非常重要 , 图片质量的高低很大程度上决定了论文能否被顺利录用 。
毋庸置疑 , 拥有赏心悦目的配图的稿件更加能够获得审稿人的青睐!
登高望远 , 学习高分文献中的精美配图是提高自身文章配图水平的不二法门 。
今天半就给大家分享从一篇2020年2月26日发表的Cell文献【1】中学习绘制南丁格尔玫瑰图、GO富集图等 , 权当抛砖引玉 。
首先 , 我为什么分享使用Excel绘图?
1、 几乎所有人电脑上都安装有Excel;
2、 Excel功能强大 , 可绘制出不逊于编程与其他专业软件的图形效果;
3、 可导出高分辨图片;
4、 Excel还能够实现一些常用软件(如Graphpad prism)绘制不了的图形 。
Excel绘制南丁格尔玫瑰图
南丁格尔玫瑰图(Rose diagrams)是英国护士和统计学家弗罗伦斯·南丁格尔(Florence Nightingale)发明的一种圆形的直方图 。
其优点是使数据易于理解 , 让人印象深刻 。
下图是国际顶级期刊Cell文章中使用的玫瑰图【1】 , 用以说明差异表达基因(DEGs)在不同组织中的分布情况:
尺有所长 , 寸有所短 。
目前常用绘图软件GraphPad Prism暂不能绘制南丁格尔玫瑰图 , 然而几乎所有人电脑中均安装了的软件Excel却可以轻松绘制漂亮的玫瑰图 。
绘制步骤:
1. 数据准备
模拟与Cell文献中类似的7组数据 , 每组所占角度为360°除以7为51.4286°:
选择步骤1得到的数据 , 菜单栏点击插入 -> 插入图表 -> 雷达图下选择填充雷达图:
3.1 选择并删除玫瑰图外围的数字:
选中图形 , 鼠标右击选择设置数据系列格式:
添加序列标签前准备好如下辅助数据:
使用XL toolbox(https://www.xltoolbox.net/)插件Import&Export下导出高清Tiff图片:
相信很多人都曾经为绘图配色而苦恼 , 无论怎么调整都觉得自己的配色“辣眼睛” 。
向高分文章学习漂亮的配色方案是一个不错的选择 。
在此继续以Cell文章【1】为例向大家分享Excel提取配色的方法!
下图是Cell文章中7个不同组织的颜色:
1. EasyCharts插件
链接:http://easychart.github.io/post/Easycharts/。
下载完成后按照说明进行安装:
2. 使用颜色拾取进行配色提取
将想参考配色图片截图导入Excel , 点击E asyCharts中的颜色拾取 , 逐一提取各组颜色 , 保存获得各颜色对应的RGB值:
以GraphPad Prism为例 , 填充颜色时选择More colors , 在RGB处填入提取的RGB值 , Add to custom colors可以保存颜色后续使用 , 不需要再次输入:
1. EasyCharts插件除可以进行颜色拾取外色轮参考亦可辅助配色:
Cell文献还对差异表达基因进行了GO分析 , 圆圈中的数字对应每一项中富集的基因数量:
1. 准备GO分析数据,绘图需使用GO分析名称(Description列)、-Log10P与基因数量:
设置柱形图颜色为灰色:
Excel绘制另类柱形图:
Cell文章中使用不同组织的模式图 , 增加了图形的趣味性 。今天半夏给大家分享一款高效模式图绘制神器——BioRender 。
BioRender包含Imuunology、Microbiology、Neuroscience等在内的30多个生命科学领域的数千个模板 。需要什么搜索即可挑选自己需要的模式图 , 例如搜索kidney:
实用网站
除了可以从Cell文章学习绘图外 , 文中还涉及了一些实用网站 。
1. Metascape
链接:http://metascape.org
Metascape【2】整合了GO、KEGG、UniProt和DrugBank等多个权威的数据资源 , 不仅能完成通路富集和生物过程注释 , 还能做基因相关的蛋白质网络分析和涉及到的药物分析 。作者使用Metascape进行了GO分析 。
链接:www.cellphonedb.org
CellPhoneDB是一种用以预测潜在的特殊的细胞间互作新型统计工具【3】 。
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