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化合物质谱数据怎么写的
手动通过输入提问谱图中一定数目的质谱峰数据(质荷比、丰度),在数据库中进行匹配,获得与提问谱相似的谱图 。
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植物代谢组 | 一文了解用于质谱定性的代谢物数据库
4 个月前 · 来自专栏 代谢组及多组学技术
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上期我们整体看了一下公共/自建数据库的类型,我们也能很清楚的发现,对于不同的数据库有着不同的用途,本期我们就具体来讲讲用于质谱数据匹配的数据库 。(点此阅读原文)
1.NIST(National Institute of Standards and Technology):包含气质平台30万+代谢物
NIST数据库是由美国国家标准技术研究院出版,一般与GC-MS平台配套使用 。对于该数据库目前没有开放使用,但是网页版本的数据库开放使用,网页版本的可以看作是NIST的标准参考数据库Standard ReferenceData中一部分与化学有关的数据库的Web版本,可通过分子式检索、化学名检索、CAS登录号检索、离子能检索、电子亲和力检索、质子亲和力检索、酸度检索、表面活化能检索、振动能检索、电子能级别检索、结构检索、分子量检索和作者检索等方法,得到气相热化学数据、浓缩相热化学数据、相变数据、反应热化学数据、气相离子能数据、离子聚合数据、气相IR色谱、质谱、UV/Vi色谱、振动及电子色谱等 。
网页链接:https://webbook.nist.gov/chemistry/
2. MassBank:包含来自气质液质不同平台不同模式共15055种物质
MassBank是一个高质量的质谱数据库,旨在公开分享从代谢物的化学标准品得到的质谱图以方便用户进行代谢物的鉴定,包含了代谢物的质谱信息以及采集情况,这些信息来自于不同的质谱仪设置,包括不同的电离技术,例如ESI、EI、 CI、APCI以及MALDI 。
MassBank有三个不同的数据库:MassBank of North America (MoNa) 、the European MassBank 、the Japanese MSSJ MassBank,其中MoNa整合了更多来源的数据,因此相比其他两个更加受到科研工作者群体的偏好 。
但是对于鉴定植物中的代谢物而言,MassBank中所包含的数据库是有限的,尤其是以质谱平台进行了限制,用于检测植物的主要是液相质谱平台,其中使用较多的是以ESI离子源为主要类型,所有包含ESI离子源这种类型的数目加起来是11592个物质 。
METLIN数据库中的质谱图可以与一些不同的质谱仪产生的谱图进行很好的匹配,包括了其中包括AB公司的 Triple TOF 5600,安捷伦的 6460 Triple Quad,Thermo的 Q-Exactive和 LTQ Orbitrap Velos(使用任何一种CID 或HCD碰撞形式) 。该数据库的不足在于所有的数据不支持下载,必须在线查看,这也使得研究者不能使用这些二级碎片信息来开发新的检索工具或者应用工具 。虽然如果实验室拥有安捷伦公司生产的质谱仪器,用户可以向生产商购买METLIN的数据库,但是购买的数据库的并不能跟网络数据库同步更新 。安捷伦的METLIN个人数据库中(personalmetabolite database,PMD)中包含有9083个化合物,其中4165个为代谢物,其他的为二肽或者三肽 。
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来自专栏代谢组及多组学技术
基于MALDI-TOF质谱成像研究不同贮藏时间下马铃薯块茎中GAs的分布及变化
期刊:Talanta
发表时间:2020.07.27
IF: 6.057
2020年7月,中国检验检疫研究院食品安全研究所张峰老师团队在Talanta上发表了题目为“The distribution and changes of glycoalkaloids in potato tubers under different storage time based on MALDI-TOF mass spectrometry imaging”的研究论文 。本研究基于质谱成像技术对不同贮藏时间的马铃薯块茎中糖基生物碱(GAs)的分布和变化进行研究,对了解马铃薯不同部位的GAs代谢和监测马铃薯的食品安全性具有重要意义 。
GAs是马铃薯等茄科植物中常见的一种次生代谢产物,也是一种天然毒物,会对人体健康和食品安全构成威胁 。GAs的合成受到许多环境因素的刺激,因此研究贮藏时间对马铃薯块茎中GAs含量和分布的影响具有重要意义 。然而常规的代谢组检测分析是在组织匀浆的处理下进行的,缺乏样本中物质的空间定位信息 。本研究基于光学显微镜和质谱MALDI-MSI联用的iMScope技术实现了主要GAs在不同贮藏时间段的含量及分布情况检测,为食品安全监测提供了参考 。
样本:常温下储藏后7个时间点(0、10、15、20、30、40、60d)的马铃薯块茎
1、检测方法的建立:GAs检测基质的选择
MALDI-MSI的成功应用严格依赖于基质的选择,本研究通过比较α-茄碱的敏感性,从常用的基质如DHB、CHCA、2,4,6-THAP、SA中筛选最优基质 。发现以DHB为基质时灵敏度最强,同时,在DHB基质下,背景相对干净 。
为了进一步比较这些基质在MALDI-MSI分析中的沉积和电离能力,本研究还在空白马铃薯块茎切片上测试了这些基质对α-茄碱的敏感性和适用性 。发现在MALDI-MSI检测GAs时,DHB和CHCA基质具有较高的适用性 。然而DHB处理的α-茄碱浓度明显高于CHCA处理的α-茄碱浓度,此外,CHCA的晶体分布不均匀,分析物没有被基质包裹 。基于以上结果,在接下来的实验中,最终选择DHB作为GAs的检测基质 。
2、检测方法的建立:优化基质沉积方法
基质沉积过程对质谱图像的质量起着重要的作用,特别是在获得高空间分辨率的高质量图像时 。此外,MALDI-MSI的空间分辨率也会受到基体晶体尺寸的强烈影响 。因此,优化基体沉积方法对分析物的检测具有重要意义 。
本研究通过比较四种GAs的信号强度以及DHB晶体的均匀性和尺寸,系统优化了升华法、喷涂法和升华&喷涂法三种基质应用方法 。对同一马铃薯块茎进行连续三段基质沉积实验 。最终选择升华&喷枪法作为进一步实验的基质沉积方法 。
3、检测方法的建立:标品定量、四种GAs的定性和碰撞能量优化
为了提供更准确的马铃薯块茎组织数据,本研究进行了α-茄碱标准品的定量实验 。采用不同浓度的α-茄碱(0.01~5μg/mL)在MALDI不锈钢靶板上沉积DHB基质 。标准曲线如图1a所示 。这一结果表明,利用DHB基质的MALDI-TOF-MSI方法可用于组织样品GAs的定性定量分析 。
马铃薯的GAs主要有两种,α-solanine和α-chaconine,其结构如图1b所示 。为了确定马铃薯块茎中的GAs,需要进行串联质谱(MS/MS)分析 。碰撞能量是获得精确次级碎片离子的重要因素之一 。以α-茄碱为标准物,优化碰撞能 。最终选取50 eV的能量作为最优碰撞能量 。
在最佳碰撞能量下,通过MS/MS分析确定了马铃薯块茎中的四种GAs: dehydrochaconine ([M + H]+ (M /z 850.49))、α-chaconine ([M + H]+ (M /z 852.50))、dehydrosolanine([M + H]+ (M /z 866.49))和α-solanine([M + H]+ (M /z 868.50) 。图1d-g显示了这四种GAs的MALDI-TOF MS/MS谱图,用于直接分析发芽马铃薯块茎组织的切片 。
浙江三四线城市抢设沪杭人才“飞地”浙江省嘉善县迈维代谢有限公司总经理唐堂前几年到武汉、西安等地招聘博士时,常常有人上来就表示,不想去县城工作,“要去上海,哪怕收入低点儿” 。抢不到高端人才,是县城许多企业家的心病 。不过,从今年11月开始,这个难题有了新解,县里引进的高端人才可以直接进驻嘉善国际(上海)创新中心,在上海办公,为嘉兴的企业服务 。
嘉善县国有企业投资公司在上海市虹桥商务区设立了一块建筑面积为两万平方米的人才“飞地”,专门服务于该县实施企业研发在上海、产业化在嘉善的发展战略 。
据嘉兴市委组织部统计,目前,嘉善、海宁、平湖等7个县市区,在上海、杭州等市建成人才“飞地”12块,总面积3.7万余平方米,聚集和最大效率利用各类创新人才资源 。
寻找“虹吸”“溢出”效应的平衡点
嘉兴市地处长三角中心地带,但是在引进博士和海外高层次人才方面,则处在上海、杭州、宁波、苏州等经济强市的夹缝中间 。加上高端人才受各地引才政策竞争带来的“潮汐”现象影响,嘉兴吸引高端人才难,留住高端人才更难 。
“俗话说,大树底下好乘凉 。不过,在引进人才、留住人才方面,往往是大树底下‘不长草’ 。”嘉善县委组织部副部长张润纯说 。
嘉兴市和嘉善县的困扰,在某种意义上也是国内三四线城市和县城实施新一轮发展战略的共同烦恼 。
张润纯说,一方面,中小城市的人才往往被高铁等便捷交通方式构成的一小时交通圈“虹吸”到了大城市 。另一方面,大城市人才济济,一部分高端人才想到中小城巿寻求更大的发展空间,出现人才的“溢出”效应 。
张润纯分析,此前,高端人才来嘉善县工作后留不住,主要是缺乏学术圈子和氛围 。同时,高端人才的家搬不过来,配偶等家人的就业问题难以解决 。另外,小县城的教育、医疗条件也不如大城市好 。
为了改变这种状况,嘉善县在长三角一体化发展战略中抢抓机遇,在上海虹桥交通枢纽附近投资9亿元,第一期购置1.7万平方米,第二期购置2400多平方米以及190个车位,全方位建设实体化的人才“飞地” 。
张润纯说,这块“飞地”被定位为嘉善企业在上海的研发中心、高科技项目孵化中心、高端人才集聚中心和高校创新创业服务示范中心等 。
在沪“飞地”工作也能享受嘉善人才普惠政策
在外建设人才“飞地”虽不是嘉兴的首创,但在突破行政壁垒,确保“飞地”上的项目、人才为本地产业和经济社会发展服务方面,嘉兴先行先试,下足了功夫 。
张润纯说,他们考察了一些地方的人才“飞地”后发现,租赁或购买写字楼、招些项目“填满楼”很容易,难就难在同本地产业结合起来 。
因此,人才“飞地”入口关要把好,项目的筛选非常重要 。张润纯说,嘉善县设在上海的“飞地”不急于把楼填满,而是注重入驻项目的科技含量和高层次人才 。目前,首轮孵化项目14个,入驻6个,在洽谈人才项目80多个 。
该县专门出台了支持人才“飞地”建议的十条意见,符合支持范围的入驻企业自实际业务开展3个月后可享受一次性开办费补助,最高5万元,另有一个车位的补贴 。入驻企业享受50%租金补贴,对于落户嘉善并实际发生投资、纳税以及吸引人才的企业,给予最高100%租金奖、100%纳税地方贡献奖 。
同时,嘉善县给这块“飞地”建立首期规模5000万元的天使基金,入驻企业可获最高150万元的资助,每年最高10万元的科技银行贷款贴息,最高30万元的创新券 。在入驻企业工作的全日制博士研究生,待企业在嘉善落地后,其在上海的缴纳社保年限可折算在嘉善的缴纳社保年限,申领面值50万元的嘉善人才住房券等 。
享受这些“飞地”政策的一个重要前提是,项目落地必须在嘉善,没有产值税收也拿不到政策 。张润纯说,如果不是落户嘉善的人才项目,在“飞地”上的办公室租金将是每天5元/平方米,商务成本高肯定待不住,不到一年就会搬走,这就是“飞地”上的市场淘汰机制 。
“人才在哪里不重要,把聪明才智贡献给嘉兴才重要 。”嘉兴市委组织部人才处处长张敏说,市委、市政府领导转变观念,高端人才的人事、社保关系转与不转没关系,只要在该市设在大城市人才“飞地”上的项目和企业工作,就可以同等享受本地人才的普惠性政策待遇,如专门针对硕士、博士研究生人才的购房补偿等 。
这在两三年前,是不可能实现的 。张敏说,过去很多人才政策都是与户籍、社保捆绑在一起的,导致人才储水池的总量就是那么大 。各类人才尤其是高层次人才共享性、流动性强,只有主动适应市场变化,开放才能包容更多 。张润纯也表示,只要给嘉兴作过贡献的人才,享受普惠性政策是应该的,即使将来有一部分人才流动也属于正常现象 。这样更有利于吸引和留住人才 。
由地下走到地上,从国内延伸至国外
三四线城市到大城市设人才“飞地”,因为怕大城市误解它们是来“挖墙脚”“抢人才”的,起初都小心翼翼不敢声张 。张润纯说,嘉善国际(上海)创新中心2017年开始购置物业后也没有对外说是人才“飞地”,直到上海市虹桥商务区管委会领导来现场调研认可后才公开亮牌子 。
在浙江省会杭州也一样,此前部分县、市和企业会在省城高校周边设立人才孵化器 。今年以来,浙江省主导建设的浙江人才大厦中,嘉兴、丽水等9个设区市已先后在此设立人才“飞地” 。浙江省省长袁家军,省委常委、组织部长黄建发近日赴浙江人才大厦调研人才“飞地”在柔性引才方面的重要使命和作用 。
浙江清华长三角研究院办公室的胡哲诚说,该院总部设在嘉兴市南湖区,已在美国纽约、波士顿,澳大利亚悉尼,英国伦敦,德国慕尼黑、法兰克福等地设立8个“离岸孵化器”,带土培植,引进海外高层次人才项目200多个 。
据介绍,嘉善县在荷兰设立了国际创新中心,上海漕河泾开发区在浙江海宁市设开发区分区,嘉兴市联合浙江省委人才办建设浙江长三角人才大厦,鼓励和支持浙江、江苏、安徽等地级市、县进驻该市引人才 。还有衢州市在杭州设人才“飞地”,湖州市在上海设“飞地”,义乌市在北京设“飞地”……三四线城市各类人才“飞地”建设正在从地下走到地上,从单向向双向发展,从企业自发到政府引导,从国内延伸至国外,既有自持和自营物业的,也有租赁房产的,还有共同合作经营的,形式、业态越来越多样化 。
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高 。武汉迈握旁特维尔生物科技有限公司,总部坐落于武汉国家生物产业基地-光谷生物城生物创新园,另设北美公司、上海/嘉善华东扰皮雀研发中心、长沙诊断产品研发与生产中心 。作为国缓早内专业的代谢组中心,迈维代谢长期专注于创新代谢组技术在生命科学研究与医学健康方面的应用,致力于成为全球代谢组技术服务及创新检测产品应用的先驱 。其中任职要求十分高:
1、生物、化学、医学、制药相关专业,本科及以上学历 。
2、3年以上ivd注册和临床试验经验,有质谱ivd产品经验者优先 。
3、良好的协调沟通能力、较强的抗压能力和复杂问题解决能力 。
4、思路清晰,有较强的公关和谈判能力 。
武汉迈特维尔生物科技有限公司怎么样?武汉迈特维尔生物科技有限公司是2015-08-31在湖北省武汉市注册成立的其他有限责任公司,注册地址位于武汉市东湖新技术开发区高新大道666号生物产业(九峰)创新基地B7、B8栋 。
武汉迈特维尔生物科技有限公司的统一社会信用代码/注册号是914201003471784816,企业法人唐堂,目前企业处于开业状态 。
武汉迈特维尔生物科技有限公司的经营范围是:生物、计算机、化学产品(不含危险品)的技术开发、技术咨询、技术服务、技术转让、技术推广;计算机系统集成;实验室仪器及设备、实验室试剂及化工产品(不含危险品)、计算机软、硬件及配套设备的研发及销售;会议服务;经济信息咨询;货物进出口、技术进出口、代理进出口(不含国家禁止或限制进出口的货物或技术) 。(依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动) 。本省范围内,当前企业的注册资本属于一般 。
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迈维代谢公司是国企吗
不是 。嘉兴迈维代谢生物科技有限公司成立于2018年06月29日,注册地位于浙江省嘉兴市嘉善县大云镇上海人才创业园,属于民营企业,不是国有企业,法定代表人为唐堂 。经营范围包括生物、计算机、化学产品(不含危险品)的技术开发、技术咨询、技术服务、技术转让、技术推广;检验检测服务 。
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