生物碱分离的方法有两种，分别为：
【如何进行生物碱的分离】1、利用碱性差异进行分离：将总生物碱溶于氯仿等亲脂性有机溶剂 ， 以不同酸性缓冲液依pH由高至低依次萃?。锛羁砂醇钚杂汕恐寥跸群蟪裳我来伪惠腿〕龆掷耄直鸺罨笠杂谢芗凛腿〖纯?。
2、利用溶解度差异进行分离：利用氧化苦参碱极性稍大难溶于乙醚，苦参碱可溶于乙醚的性质，将苦参总碱溶于氯仿，再加入10倍量以上的乙醚，氧化苦参碱即可析出沉淀 。
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