位点|MSI检测需聚焦主流、聚焦权威——5个位点的微卫星不稳定检测才是主流权威

由于微卫星不稳定(MSI)在泛癌种中具有明确且重要的临床检测意义 , 现已被国内外众多临床指南共识强烈推荐常规检测 。 临床对于MSI的检测需求越来越明确 , 是否检测MSI现已不再是问题 , 如何选择检测位点给患者带来最准确的检测结果才更加需要注意 。
文章来源:南方医学网
人类基因组中已知的微卫星位点数目已有1900万个 [1], 而如何在众多位点中选择最具有代表性的微卫星位点 , 国内外指南共识其实早有定论 。纵观国内外指南 , 明确推荐用于MSI检测的Panel都是由五个位点组成 , 即美国癌症研究中心(NCI)提出的由两个单核苷酸位点和三个双核苷酸位点组成的2B3D NCI Panel(BAT-26、BAT-25、D5S346、D2S123、D17S250)和由5个单核苷酸位点组成的Promega Panel 。 并且 , 5个位点的判定标准也是一致的:5个位点中 , 2个及以上的位点不稳定为MSI-H;5个位点中1个位点不稳定为MSI-L , 5个位点均稳定为MSS [2]。 目前没有任何指南推荐6个及6个以上的单核苷酸位点 。
图 1 NCCN指南明确推荐5个位点组成的两套Panel以及判定标准
指南共识所推荐的两套位点中 , 2B3D NCI Panel从被提出以来一直被指南共识所推荐 , 其推荐地位从未被动摇 。 而5个单核苷酸位点Panel还是经过了较为复杂的演进过程 , 最初是法国人类多态性研究中心基于高加索人群数据提出的Pentaplex Panel(BAT25、BAT26、NR-21、NR-22、NR-24) [3], 该Panel被Revised Bethesda指南推荐 [4]。 后来 , 美国Promega公司在Pentaplex Panel上做了进一步改进 , 将NR-22替换为Mono-27推出了Promega Panel(BAT-25、BAT-26、NR-21、NR-24、MONO-27) 。 基于此 ,NCCN指南推荐2B3D NCI Panel和以Promega Panel为主的5个单核苷酸位点Panel用于MSI检测 , 而没有任何指南推荐6个单核苷酸位点 。

位点|MSI检测需聚焦主流、聚焦权威——5个位点的微卫星不稳定检测才是主流权威
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表 1 不同检测Panel指南推荐与临床研究应用情况
同时 , 国内外各种PD-1/L1免疫检查点抑制剂的大型临床研究入组MSI-H患者的筛选位点都遵循了指南推荐 , 选择的2B3D NCI Panel或Promega Panel由5个位点组成的检测Panel , 比如帕博利珠单抗的临床研究中以上两种Panel都使用过;纳武利尤单抗、阿维鲁单抗、德瓦鲁单抗的临床研究则更多使用的是2B3D NCI Panel 。 而目前公开的数据和研究中 , 没有任何临床研究是用的是5个位点以上的MSI检测Panel 。 因此 , 6个位点的检测Panel并没有免疫治疗伴随诊断的数据支持 。
图 2 大型临床研究采用5个位点的2B3D NCI Panel或单核苷酸位点
近日 , 市面上有些声音将某个由6个单核苷酸位点组成的Panel与指南共识推荐和临床研究中使用的Pentaplex Panel或Promega Panel混同 , 企图混淆视听 。 可以详细比较一下Pentaplex Panel、Promega Panel 和6个单核苷酸的Panel 。
表 2 单核苷酸Panel位点信息
可以看出 , 6个单核苷酸位点与Pentaplex相比 , 少了NR-22位点 , 且多了NR-27和MONO-27位点 , 同时也比Promega Panel多一个NR-27位点 。而基于国内人群不同检测Panel的MSI-H检出率的META分析结果显示 , 6个单核苷酸位点Panel的MSI-H整体检出率远低于5个单核苷酸的Promega Panel , 所有组合中 , 检出率最高的还是2B3D NCI Panel[9]。
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表 3 中国人群不同MSI检测Panel检出率汇总
那么同样是单核苷酸Panel , 为什么6个单核苷酸比Promega的检出率低呢?我们发现 , 6个单核苷酸位点相比Promega位点多出了NR-27位点 , 这个位点是从哪里来的呢?我们在这一篇发表于Disease Markers(影响因子=3.434)杂志的文献中 , 发现了NR-27的选择原因 。