牙买加West Indies大学一项研究显示抗环斑病毒转基因木瓜对试验大鼠的胃肠道影响与传统对照相当 。Melissa Powell及其同事研究了长期食用转基因木瓜对大鼠肠道组织学及某些生化参数（酶活性）的影响 。

研究发现这些大鼠“肠粘膜的完整性未发生形态学改变” ， “饲料射入量、体重、排泄量未受影响” 。研究最后表明 ， 含转基因木瓜的饮食对其肠内微生物数量、β葡糖苷酸酶、二糖酶和淀粉酶活性没有影响 。

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