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胃肠道的不同部位分布着不同的微生物群落 ， 因此粪便成分不能完全反应肠道微生物的复杂性 。 在这项研究中 ， 研究人员采集了C57BL/6小鼠胃、空肠、回肠、盲肠和结肠等区域的胃肠腔以及黏膜的样本 ， 并对真菌核糖体DNA进行测序分析 。
结果发现 ， 与肠道细菌不同的是 ， 胃肠腔和黏膜的真菌群表现出显著的差异 。 不管纵向取样位置如何 ， 腔内真菌群落（LUM）都表现出很高的多样性 ， 然而 ， 黏膜相关真菌群落（MAF）的多样性则要低一些 。
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胃肠腔（luminal）内真菌群落与黏膜（mucosal）相关真菌群落有着显著差异
【影响|《细胞》：肠道真菌也能控脑！康奈尔团队首次发现肠道真菌影响动物社交行为丨科学大发现】既然胃肠腔和黏膜的真菌群落在组成上有着显著差异 ， 它们在对肠道免疫反应的调节上是否也会有所不同呢？
Iliyan D. Iliev团队将鉴定出的胃肠腔或黏膜真菌移植给小鼠 ， 并评估化学药物诱导的肠道损伤作用 。 结果发现 ， 移植黏膜真菌可以防止小鼠的肠道损伤以及相关的死亡 ， 而胃肠腔真菌却没有保护作用 。
和这一发现类似的是 ， 移植黏膜真菌还可以防止柠檬酸杆菌引发的结肠炎 。
那么 ， 黏膜真菌是如何发挥这些保护作用的呢？
Iliev团队发现 ， 在移植黏膜真菌的小鼠结肠固有层和肠系膜淋巴结中 ， 有一类辅助型T细胞——Th17细胞显著增加 ， 这些细胞能分泌大量的细胞因子如IL-22和IL-17 。 研究人员发现 ， 黏膜真菌诱导的肠道保护作用正是依赖于IL-22的产生 。
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相比于胃肠腔真菌 ， 黏膜真菌移植可以显著增加肠道Th17细胞（FoxP3-RORγt+）的比例
过去的十年里 ， 大量的研究发现肠道细菌和神经系统（即肠脑轴）之间存在双向沟通 。 肠道细菌的失调与焦虑、抑郁 ， 甚至自闭症等都有着密切关系[2, 3] 。
最近的一些研究发现 ， 肠道真菌群落的组成在人类行为变化相关的神经精神疾病中发生改变[4, 5] ， 然而目前关于真菌群落对神经免疫和神经退行性疾病的影响知之甚少 。
在本研究中 ， Iliyan D. Iliev团队发现黏膜真菌在促进社交行为方面的有意想不到的作用 。 他们发现 ， 与肠道细菌相比 ， 黏膜真菌不影响小鼠重复、焦虑和强迫相关的行为 。 相反 ， 黏膜真菌定殖促进了小鼠的社交行为 ， 且这一作用并不受肠道细菌的影响 。
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