朱祁钰登基之后 ， 还下诏边关守将不得听信瓦剌的借口 ， 使得瓦剌意图用明英宗的名义骗取财物、骗开关门失败 。 瓦剌气急败坏 ， 发兵攻打北京 。 朱祁钰任用于谦等人 ， 组织北京保卫战 ， 整肃内部 ， 调集重兵 ， 安定人心 ， 最终在同年十一月击退瓦剌 ， 取得北京保卫战的胜利 。
突如其来登上皇位 ， 大权在握 ， 朱祁钰也就不愿意放手 。 北京保卫战之后 ， 明军多次击败瓦剌 。 瓦剌首领也先见此 ， 便想放了明英宗 ， 借此求和 。 他想放 ， 可是朱祁钰却不愿意接 。 大臣建议朱祁钰迎回明英宗 ， 他不悦 ， 说当初是你们逼着我当这个皇帝 。 这个时候 ， 于谦说 ， 您已经当了皇帝 ， 即便他回来 ， 帝位还是您的 。 朱祁钰见最得力的大臣都这么说 ， 便派人去瓦剌接触 ， 看究竟是怎么回事 。
使臣杨善这一去 ， 居然就把太上皇接回来 。 朱祁钰随即把哥哥软禁在南宫 。 一锁就是七年 。 在中国历史上 ， 汉族的皇帝被俘后不附带任何屈辱的条件就被放回来 ， 这还是第一次 。
明英宗抵达北京后 ， 由安定门入城 。 之后 ， 改乘法驾 ， 入东安门 ， 朱祁钰自东安门出迎 ， 行拜见之礼 ， 明英宗答拜 ， 互拉双手 ， 泪涕沾襟 ， 相互推辞逊让了许久 。
明英宗回归之后 ， 虽为太上皇 ， 却被软禁在南宫 。 朱祁钰从内心来讲并不希望明英宗回朝 ， 为防备明英宗与旧臣联系 ， 对他的一举一动 ， 都严加防范 。 朱祁钰竟接受太监高平的建议 ， 将南宫的树木全部砍伐 ， 以防有人越过高墙与明英宗联系 ， 果然如于谦所说明英宗的回归没有影响到朱祁钰的帝位 。
随着帝位渐渐巩固 ， 朱祁钰并不满足 ， 他不仅自己要做皇帝 ， 而且希望自己儿子朱见济能够取代明英宗的太子朱见深成为皇位的合法继承人 。
土木之变之际 ， 张太后命朱祁钰监国 ， 差不多同时也立明英宗之子朱见深为太子 。 张太后的用意很明白：大明江山依然是明英宗的 ， 朱祁钰只不过是代理执政而已 。 明英宗还京后 ， 朱祁钰保国有功 ， 未把皇位交还给明英宗还说得过去 ， 但他反把明英宗之子的太子位也废了 ， 朝臣上下认为朱祁钰私心过重 ， 有失民心 。 贵州道监察御史钟同曾言：“太子薨逝 ， 足知天命有在 。 ”同时兼陈一切弊政 。 朱祁钰闻讯大怒 ， 钟同被下狱杖死 。
由于太子是皇太后立的 ， 朱祁钰不得不慎重 。 他先试探颇有资历的太监金英 ， 说“七月初二日 ， 东宫生日也” 。 金英立刻回答 ， “东宫生日是十一月初二日 。 ”前者是朱见济的生日 ， 后者是太子朱见深的生日 。
初步试探没有达到理想的效果 。 因此朱祁钰很是隐忍了一段时间 。 然而 ， 他仍旧不停地试探 ， 甚至贿赂朝臣 ， 不惜武力威慑 。 终于换来宦官和朝臣的默认 。 他们睁一只眼闭一只眼 ， 可是他的汪皇后坚决不能同意丈夫的做法 。 她悍然争辩 ， 却被废了皇后 ， 打入冷宫 。 就这样 ， 景泰三年（1452年） ， 朱祁钰把侄子朱见深的皇太子废掉 ， 立自己的儿子朱见济 。 不想到了第二年 ， 朱见济就夭折 。

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