单基因分析+简单实验，就可以发表6分+

作者：作图丫
导语
EEF1E1在卵巢癌、乳腺癌、非小细胞肺癌和其他癌症中发挥作用，但其在肝细胞癌（HCC）中的作用和机制尚不清楚。
背景介绍
今年小编为大家带来一篇单基因肿瘤分析发表了6分+的文章，让我们一起看看有什么与众不同之处吧！文章题目为ANovelHCCPrognosisPredictorEEF1E1IsRelatedtoImmuneInfiltrationandMayBeInvolvedinEEF1E1/ATM/p53Signaling 。

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数据介绍
来自TCGA、ICGC、CPTAC的公共数据库。
研究设计

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结果解析
01EEF1E1的差异表达
MannWhitneyU检验显示， EEF1E1在肿瘤中的表达高于正常水平，差异有统计学意义（P<0.001）（图1A）。 t检验显示肿瘤高于正常水平的平均水平，差异有统计学意义（t=7.572 ， P<0.001）（图1B）。
为了确认EEF1E1的表达模式和临床意义，从国际癌症基因组联盟（ICGC）数据库（https://dcc.icgc.org/）项目中检索并获得了肝细胞癌队列（包括202个正常对照和243个肿瘤标本）的基因表达谱。 Kaplan-Meier分析表明， EEF1E1在癌症中的表达水平显著高于正常水平。
为了确定两组（癌症和正常，癌症和癌旁）之间EEF1E1蛋白表达的差异，根据临床蛋白质组学肿瘤分析联盟（CpTAC）（https://cptac-data-portal.georgetown.edu/datasets）的标准化数据分析了330例肝细胞癌和副组织。结果表明， EEF1E1蛋白在癌组织中的表达显著高于对照。同EEF1E1蛋白在癌组织中的表达显著高于邻近组织中的表达（图1C）。
为了进一步验证EEF1E1表达的结果，收集了22例含有癌症和癌旁癌的HCC样本，并通过免疫组化检测EEF1E1表达。 EEF1E1在HCC细胞的细胞核和细胞质中均有表达，但主要在细胞质中表达。同时，癌症中的EEF1E1蛋白水平明显高于癌旁。

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图1
02EEF1E1表达与临床特征
EEF1E1的表达与肝癌患者体重呈正相关。 MannWhitneyU检验显示，体重>70患者EEF1E1表达水平低于体重<70患者。

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图2

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图3
EEF1E1表达水平与AFP水平显著相关。在组织学分级中， G1EEF1E1的表达与G3和G4的表达差异有统计学意义， G2EEF1E1的表达与G3的表达差异有统计学意义。在T期， EEF1E1在T1中的表达与T2和T3的表达有显著差异，但与其他阶段无显著差异。 EEF1E1表达与M期和N期无关。 EEF1E1在I期的表达与II期和III期的表达有显著差异。

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图4
以上结果表明， EEF1E1的表达水平与体重、BMI、肿瘤状态、血管浸润、AFP、物流分级、T分期和病理分期有关（图2-5）。
03EEF1E1是肝癌的独立预后指标
KaplanMeier生存分析用于评估EEF1E1mRNA和蛋白表达在肝癌患者预后中的价值。结果显示， EEF1E1的表达与肝癌患者的预后相关。与EEF1E1低表达患者相比， EEF1E1高表达患者的预后较差，无论是总生存期、疾病特异性生存期还是无进展生存期（图3）。
EEF1E1表达水平对肝癌患者预后的影响也与年龄、体重、性别、种族、BMI、AFP、血管浸润、M0、N0 。此外， EEF1E1表达水平对肝癌患者预后的影响也与T分期、病理分期、组织学分级等有关（图4）。
作者使用单变量Cox回归分析评估了与OS相关的变量。单因素Cox模型显示，高EEF1E1表达与OS较差密切相关， T分期、病理分期、组织学分级也是如此。多因素Cox回归显示，高EEF1E1表达是与OS相关的唯一独立预后因素。