代谢|观察|当质谱技术结合人体代谢物,泛癌筛查还有哪些挑战?( 四 )


最后一个挑战则是来自质谱仪的基质材料 。 论文中也指出 , 激光解吸/电离(LDI)通常需要一个辅助的有机基质将能量传递给分析物 , 由于基质的本底离子 , 小分子代谢物检测的准确性受到影响 。 而纳米材料辅助的方法可以很好地适用于LDI研究低质量范围的代谢组学 , 这些纳米材料在吸收激光能量的同时 , 不会产生令检测信号复杂化的团簇离子 。
代谢|观察|当质谱技术结合人体代谢物,泛癌筛查还有哪些挑战?
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两种纳米材料的制备 。
钟晟也进一步解释道 , 从传统的MALDI-TOF质谱来讲 , 用的最多的基质是有机小分子基质 , 比如说 CHCA(a-氰基-4-羟基肉桂酸) , 或者是DHB(2 , 5-二羟基苯甲酸)等 。 “小分子基质在做代谢物检测的时候会存在一个问题 , 因为它本身的分子量就是跟检测的这些代谢物的分子量是相似的 , 所以如果用这种有机小分子基质来做检测的话 , 它会存在一个很大的信号干扰 。 ”正因如此 , 传统的MALDI-TOF检测的往往是大分子 , 例如微生物的膜蛋白检测 , 或者是用于单核苷酸多态性(SNPs)分型等 。
论文中同时指出一点 , 此前的研究一般都依靠单一的纳米材料基质进行LDI分析 , 指纹分析信息有限 , 容易出现误报 。
在这项研究中 , 研究团队在经过大量的筛选后 , “最终确定了两大类可行的纳米材料 , 能够对我们检测的质谱检测的信号进行很好的富集和放大 , 最终得到高质量的数据结果 。 ”钟晟表示 。 第一种类型的纳米材料是第一种纳米材料是Au/SiO2核/壳纳米粒子 , 第二种类型的纳米材料则是利用Agassisted化学蚀刻技从n型硅片上获得的高多孔性硅纳米线 。
“纳米材料在这项研究中最核心的作用就是去放大激光能量 , 并且由于纳米材料具有物理化学的稳定性 , 它比较难产生小分子区间的干扰 , 所以相比传统的基质材料 , 在做代谢物或者小分子物质检测上面 , 它有较强的独特优势 。 ”
值得一提的是 , 目前国内使用的质谱仪系统多数由德国布鲁克、美国SCIEX、日本岛津等进口厂商主导 , 而钟晟等人创建的泰莱生物的团队还在进行质谱仪的国产化 。 “我们转向仪器自研国产化是基于实际科研需求 , 也符合宏观政策的方向 。 从整个产业的角度来看 , 我们认为上游仪器‘卡脖子’的问题也必须解决 。 ”郑杰表示 。
钟晟则谈及 , 如果类比称手机或者电脑 , 质谱仪也会涉及很多零部件的采购 , “激光器、探测器、采集卡 , 包括无数的电源、开关、芯片 , 包括印制线路板 PCB等 , 里面的各个零部件难免涉及到跨国采购 。 但是这不仅仅只是个单纯组装的过程 , 需要对各个零部件有深刻的了解和对真实业务场景需求的理解 , 通过不断的调试和测试数据的反馈 , 才能做出一台真正适合自己的质谱仪 。 ”他同时提到 , MALDI-TOF也是目前各类型质谱仪中国产化进度最快的一个平台 , “目前我们的国产化率基本上可以实现85%以上 。 ”
郑杰同时强调一点 , 无论是纳米基质材料的筛选 , 还是质谱仪的国产化 , 这些研究并不仅仅是一项科学实验 , “它最终还是反映到数据上 , 让检测结果真正可实现基层应用 。 ”
多种液体活检策略的结合可进一步提高准确性
在这项研究中 , 研究团队从中国两个医院选取的队列进行了MNALCI泛癌筛查测试 。
【代谢|观察|当质谱技术结合人体代谢物,泛癌筛查还有哪些挑战?】上海队列由1008人组成 , 包括203名健康对照组和805名被美国癌症联合委员会(AJCC)诊断为I-IV期癌症的患者:其中肝癌(n = 139)、肺癌(n = 76)、胰腺癌(n = 97)、结直肠癌(n = 238)、胃癌(n = 119)和甲状腺癌(n = 136) , 来自中国上海复旦大学附属中山医院 。