代谢|观察|当质谱技术结合人体代谢物,泛癌筛查还有哪些挑战?( 五 )


合肥队列包括175人 , 其中包括30名健康对照组和145名I-IV期癌症患者:肝癌(n = 29)、肺癌(n = 28)、结直肠癌(n = 30)、胃癌(n = 30)、甲状腺癌(n = 28) , 作为该研究的外部验证队列进行进一步调查 。 遗憾的是 , 在合肥队列中缺乏胰腺癌的病例 。
结果显示 , 在内部验证队列中 , MNALCI表现出了93%的灵敏度和91%的特异性;在外部验证队列中表现出了84%的灵敏度和84%的特异性 。 此外 , 在上述6种癌症中 , 识别肿瘤组织的总体准确性在内部验证队列中为92% , 在外部验证中为85% 。
研究团队发现了多达8个代谢物生物标志物 。 即2-氧代戊酸、组胺、葡萄糖、5-羟甲基尿嘧啶、2-糠酸、甲基丙二酸、4-甲基儿茶酚和L-肉碱 , 这些代谢物中 , 有大部分在其他地方被报道过与癌症有关系 。
研究团队在论文中强调 , 需要注意的是 , MNALCI方法并非要取代其它液体活检方法 。 相反 , 这种方法可与如mRNA、miRNA、突变的或5-羟甲基化的cfDNA、循环蛋白等其它生物标志物筛选策略相结合 。 他们还指出 , MNALCI方法并不能区分NSCLC、CRC和PTC中常见的致病性突变 。 然而 , 基于cfDNA突变的液体活检在很大程度上依赖于驱动基因的突变 , 对于具有阴性驱动基因突变的癌症(占癌症中的很大一部分)来说 , 其灵敏度可能会受影响 。
代谢|观察|当质谱技术结合人体代谢物,泛癌筛查还有哪些挑战?
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MNALCI与血清肿瘤抗原诊断特异性肿瘤的比较 。
研究团队认为 , 多种液体活检策略的结合可以提供额外的信息 , 进一步提高癌症诊断和识别肿瘤组织来源的准确性 。
郑杰也对澎湃新闻采访人员表示 , 多组学是未来的一个大趋势 。 “代谢物是信号通路的终端产物 , 代谢物的信息和最终的表型更为接近 , 更利于癌症的分型和标志物的发现 , 但我们也认为临床患者的真实情况应该是从生命多个维度去反映的 , 所以我们也正在去从多组学这个方向去探索一些癌症的研究 , 会结合基因组、代谢组、影像组等 , 融合 。 ”
钟晟则强调一点 , 肿瘤检测其实有非常细分的场景:“肿瘤的普筛(或叫肿瘤初筛) , 到高危人群的精筛 , 再到疑似肿瘤患者的早期诊断 , 再到临床金标准诊断 , 至少可以分为4个阶段或4个场景去做产品的设计和迭代 。 ”
而他认为 , 从当前的技术来看 , “这十几年里很难做到一种技术能够同时解决筛查和诊断的问题 。 ”
“我们的真实的感受是 , 针对不同场景 , 我们从样本的采集、样本的处理到建库 , 再到算法 , 直至最后模型 , 这些都是不一样的 。 ”郑杰也类似提及 , “而无论是质谱技术 , 还有影像分析技术或是基因组技术 , 通过不同技术的搭配 , 然后再结合样本的采集处理 , 还有和算法相互结合 , 我们会有不同的方案去针对不同的场景解决癌症的这样一个大的话题 。 ”
研究团队在论文中还总结提到 , 这行研究为实现高性价比和高通量的多癌种筛查技术奠定了概念和实践基础 。 “在不远的未来 , 该方法的检测成本预估可低于100美元 , 一个设备齐全的实验室每天可分析超过3000个样本 。 ”
论文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-021-26642-9