靶向KRAS:肺癌疾病控制率96%,实现“不可实现”的梦想

在未实现之前 , 很多梦想都仿佛是不可实现的 。
——曼德拉
阿基米德说:给我一个支点 , 我可以撬起整个地球!
科学家说:给我一个“空隙” , 我就能在癌症靶点分子上扎下一个“楔子” , 抑制住癌细胞的活性!
癌基因KRAS所编码的蛋白 , 也是癌症治疗的靶点 。 可惜的是 , KRAS蛋白太光滑 , 根本找不到“空隙” , 一直难以设计出有效的药物!
NoZuoNoDie 。 得意忘形的KRAS发生G12C突变之后 , 无意中提供了一个锚点 , 让不可能成为了可能 。
今年2月15日 , 美国FDA接受了MiratiTherapeutics递交的KRAS靶向药adagrasib的上市申请 。 KRAS靶向药是怎么设计出来的?到底能干什么?市场又有多大?希望这篇文章能讲清楚 。
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KRAS:“无法靶向”的驱动基因突变
癌细胞里有很多基因突变 , 这些突变一般可以分成两类:一类突变是“驱动基因突变” , 另一类是“乘客基因突变” 。
顾名思义 , “驱动基因突变”驱动了细胞的癌化 , 所以突变基因所编码的蛋白 , 也就成为癌症靶向治疗的靶点;而“乘客基因突变”只是搭了便车 , 碰巧发生在癌细胞中 , 这类突变对细胞癌化没有重要影响 , 也就不是治疗癌症的靶标 。
这个不难理解 , 比如说“酒驾” , 查的就是司机 , 不是乘客 。
KRAS是一个很重要的基因 , 在很多癌症里都有突变 。 有多普遍呢?大约15%的癌症患者身上都有KRAS突变(1) 。
KRAS突变就属于“驱动基因突变” , 本可以作为靶向治疗的目标 , 但长期以来 , 靶向KRAS突变都是“不可实现的的梦想” 。
为什么会这样?
一般设计小分子抑制剂药物的时候 , 都要在靶点分子的结构里找到一个“空隙” , 设计出来的药物分子就像是一个“楔子” , 插入这个“空隙”后 , 能够稳定地结合在靶点分子上 , 并导致靶点分子的结构变形 , 影响其功能 。 可以这么说 , 药物设计就是一个“见缝插针”的活 。
但是KRAS这个靶点是个不一样的烟火:表面太“光滑”了!找不到“空隙” , 不管是针还是牙签 , 都插不进去 。
所以 , 在很长时间里 , 设计新药的科学家简直都是KRAS的嘲笑对象 , 仿佛在说:“就喜欢你看不惯我却又干不掉我的样子!”
2
KRASG12C:突变让“不可能”成为可能
有人喜欢凡尔赛 , 有人喜欢得瑟 。
KRAS也喜欢得瑟 。 KRAS的得瑟 , 就是产生各种突变 。 但是 , 言多必失 , 得瑟太多了 , 总会露出马脚!
在KRAS常见的突变中 , G12C突变比较特殊:在第12号氨基酸的位置 , 原来的甘氨酸(Gly)变成了Cys , 这是一个半胱氨酸残基 。 在药物设计中 , 有一种不可逆抑制剂 , 可以与靶点分子上半胱氨酸上的巯基(-SH)形成共价键 , 让抑制剂紧紧地吸附在靶点分子上 。
靶向KRAS:肺癌疾病控制率96%,实现“不可实现”的梦想
文章图片
图:半胱氨酸
而KRAS产生的这样一个G12C突变 , 等于是突然给药物分子变出一个锚点!本来不好针对KRAS设计药物的 , 现在就有机会了!
对KRAS来说 , 这就是“不作死 , 就不会死”!
KRAS要保持致癌的活性 , 就需要能量分子GTP 。 KRAS不停地消耗GTP , 癌细胞就不停地生长 。 有了G12C , 就可以设计一个不可逆的抑制剂作为“楔子” , 插到KRAS里 , 让它卡顿在一种失活的状态 , 无法再继续消耗GTP 。
这听上去有道理 , 但是真正可行吗?
我们可以来了解一下一个靶向KRASG12C的抑制剂:Adagrasib(MRTX849) 。
无图无真相 , Adagrasib与KRASG12C共价结合的晶体结构图 , 已经被拍照了(2) 。