均一性(>0.2X测序深度占比):测序深度超过平均测序深度0.2倍的位点所占比例 , 表征目标区域测序覆盖的均一程度 。
序列mapping率:比对到参考基因组(Hg19)的序列数目占比 。
测序碱基Q30比例:测序数据中碱基错误率在千分之一以下的占比 。
常见英文缩写:
【体细胞|怎样看懂一份基因检测报告:报告常见名词解释】NGS (Next Generation Sequencing):下一代测序技术 , 也称为高通量测序技术 。
PD-1(programmed cell death protein 1):程序性细胞死亡蛋白1 , 也称为CD279(分化簇279) , 是一种重要的免疫抑制分子 。
PD-L1(Programmed cell death 1 ligand 1):程序性细胞死亡-配体1也称为表面抗原分化簇274(cluster of differentiation 274 , CD274)或 B7同源体(B7 homolog 1 , B7-H1) , 是人类体内的一种蛋白质 , 由CD274基因编码 。
HRR(Homologous recombination repair):同源重组修复 ,是DNA双链损伤的核心修复方式之一 , 其通过对DNA的同源链的重组 , 完成对双链损伤部位的修复 。
HRD(Homologous recombination repair defect):同源重组修复缺陷 , 当DNA出现双链断裂时 , 细胞失去了通过同源重组的方式对断裂进行修复的能力 。
MRD(Minimal residual disease):微小残留病灶 , 指癌症患者在治疗中或治疗后仍有残留的恶性细胞存在 , 是癌症复发的主要原因 。
dMMR(mismatch-repair deficiency):错配修复缺陷 。 错配修复是由一系列高度保守的基因及其表达的产物酶构成 , 具有维持DNA复制的高保真度和基因组稳定性、降低自发突变的功能 。
PARP(poly-ADP-ribose polymerase)抑制剂:聚腺苷二磷酸-核糖聚合酶抑制剂 , PARP抑制剂通过抑制肿瘤细胞DNA损伤修复、促进肿瘤细胞发生凋亡 , 从而可增强放疗以及烷化剂和铂类药物化疗的疗效 。
HGVS(Human Genome Variation Society):人类基因组变异协会 , HGVS变异命名规则是目前学术界所公认的突变命名规则 。
NCCN(National Comprehensive Cancer Network):美国国立综合癌症网络 , 每年发布的各种恶性肿瘤临床实践指南 , 得到了全球临床医师的认可和遵循 。
AMP(Association for Molecular Pathology):美国分子病理学会 。
ASCO(American Society of Clinical Oncology):美国临床肿瘤学会 。
CAP(College of American Pathologists):美国病理学家学会 。
CSCO(Chinese Society Of Clinical Oncology):中国临床肿瘤学会 。
ACMG(American College of Medical Genetics and Genomics):美国医学遗传学与基因组学学会
参考资料:百度百科;维基百科 。
仁东医学六周年全新企划之《报告解读系列:怎样看懂一份基因检测报告》共有6课 , 作为该系列的第一课:报告常见名词解释的科普 , 到这里就结束了 。 当然 , 仅仅知道这些名词的意思是远远不够的 , 在后续的栏目中 , 遗传咨询部将会给大家逐步推送报告解读的进阶知识 , 帮助患者一步步地去读懂自己的基因检测报告 。 如果您对本期内容有任何专业方面的疑问 , 欢迎在评论区留言 , 小编也会在第一时间解答您的疑惑 。
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2021年12月29日(下周三)早上8点钟 。 “仁东医学六周年全新企划”第五期 , 将由仁东医学质量管理部来和大家谈谈《您完全可以信任的实验室管理体系:人员能力-实验员要具备哪些能力?》 。 敬请关注!
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