拷贝数|用了很多昂贵抗癌药仍没有得到有效控制？可能是忽略了基因检测

肿瘤患者经常会遇到这样的治疗困境：根据既往临床经验或诊疗指南用了很多昂贵的化疗药或靶向药，但是病灶并没有得到有效的控制。这是为什么呢？
因为不同的患者个体、不同的肿瘤，对于各种化疗药和免疫靶向药物的敏感性均不相同。那么，有什么办法能预先判断出每个患者适合用的药物呢？
基因检测主要用于判断基因是否出现突变，以及是否存在致癌基因，为患者选择合适的靶向药物、指导常规化疗效果与预后评估。

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什么是基因检测？
基因检测是指通过血液、其他体液、或细胞对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测。
通过与基因库的对比，分析它所含有的各种基因情况，从而使人们能了解自己的基因信息，可以预知身体患疾病的风险。
通过改善自己的生活环境和行为习惯，避免或延缓疾病的发生，或在已经发生恶性疾病的情况下，确定有无特定药物靶点，使治疗方式的选择更加精准。
肿瘤基因突变来源
肿瘤基因突变主要来源于体细胞突变和胚系突变。
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胚系突变
又称生殖细胞突变，是来源于精子或者卵子这些生殖细胞的突变，因此身上所有的细胞都带有突变，目前主要是BRCA1/2，一般研究较少。当卵子和精子结合时，合二为一的受精卵细胞接受来自双亲的DNA。如果这个DNA有一个突变，孩子从受精卵发育开始，他/她的每个细胞将带有这个突变。
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体细胞突变
又称获得性突变，是指在生长发育过程中或者环境因素影响下后天获得的突变，通常身上只有部分细胞带有突变。获得体细胞突变（精子和卵细胞以外的细胞）不能遗传给下一代。这种突变类型在肿瘤患者中比较常见。
肿瘤基因突变类型
肿瘤之所以会发生，归根结底是由于身体内累积了许多基因突变，导致基因功能发生改变。
癌细胞中可能发生许多类型的基因改变。主要类型包括：
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基于DNA的改变
常见的基因变异主要包括碱基替换、短片段插入/缺失突变（Indel）、拷贝数变异（CNV）、重排（融合）。
①碱基替换：由一个错误的碱基对替代一个正确的碱基对的突变。
②插入/缺失：指在基因组的某个位置上所发生的小片段序列的插入或者缺失，其长度通常在50bp以下。并不是单个碱基的变化，而是在基因组中发生不同大小的DNA段的插入或者缺失。
③拷贝数变异：指在人类基因组中广泛存在的，从1000bp（碱基对）到数百万bp范围内的缺失、插入、重复和复杂多位点的变异。
④重排：这些是由双链断裂和随后发生在基因组中的修复介导的事件。当这些断裂被修复时，基因组中的标志物的位置往往会改变或完全被移除。
⑤基因融合：指两个或两个以上基因的部分或全部的序列构成一个新的杂合基因的过程。一般来说，基因融合是指基因组层面的融合。但转录组层面也可能发生融合，主要是由于两个不同基因转录产生的RNA，由于某种原因融合在了一起，形成新的融合RNA，该RNA可能编码蛋白，也可能为非编码。而基因组层面产生的融合基因，根据融合的情况，可能表达，也可能不表达。

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基于mRNA的改变
mRNA可以在癌症中存在或不存在。当存在时，它们有时会“过度表达”（表达水平高于正常水平）。通常在DNA水平检测突变更容易，而如果要检测ALK、ROS、NTRK等近两年靶向研究突破重大的融合突变，则需要在mRNA水平上检测才更为准确。