团队|科技创新助推高质量发展,北医三院多项科技成果发表

北京大学第三医院(以下简称“北医三院”)围绕科技创新工作 , 通过平台搭建、资源配置、经费支持等多方面 , 为全院开展创新工作搭建了广阔的舞台 , 创造了科技发展新生态 。 各研究团队积极探索 , 创新能力明显提升 , 各研究团队取得了多项科研成果 。
本期向大家介绍3篇在国际高水平期刊上发表的成果 。
毛凤彪研究员/乔杰院士团队建立首个实现eccDNA数据整合和表观遗传调控预测的分析平台
2022年1月7日 , 北医三院毛凤彪研究员/乔杰院士团队和中科院北京基因组研究所李明锟团队合作在Biochemistry & Molecular biology(生物化学与分子生物学)领域排名第八的 Nucleic Acids Research 数据库专刊上发表了“CircleBase: an integrated resource and analysis platform for human eccDNAs”的论著 ,建立了预测染色体外环状DNA(eccDNA)在表观遗传层面调控基因表达功能的数据库平台CircleBase , 通过结合测序数据集、计算预测和手工注释等 , 对目前公开发表的60多万个eccDNA表观遗传调控潜能完成了系统的梳理和预测 。
随着高通量测序技术的快速发展 , 人类基因组中发现了成千上万个染色体外环状 DNA(eccDNA) 。 因为eccDNA和线性染色体具有序列同源性 , 功能缺失实验很难在环形和线性染色体上独立进行 。 因此解释eccDNA的分子功能极具挑战性 。
数据库平台包括靶向基因、表观遗传调控、调控元件、染色质可及性、染色质相互作用和遗传变异六大部分 。 CircleBase提供了一个用户友好的界面 , 用于搜索、浏览和分析各种细胞/组织类型中的eccDNA , 为筛选潜在的功能性eccDNA并解释它们在人类癌症和其他疾病中的分子机制提供了有力工具 。
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CircleBase数据库流程图
此工作由北医三院、中国科学院北京基因组研究所、武汉大学人民医院等机构联合完成 。 北医三院毛凤彪研究员、乔杰院士和中科院基因组所李明锟为该论文的通讯作者 , 北医三院赵晓璐副研究员、中科院基因组所史雷胜博士和武汉大学人民医院阮莎莎博士为该论文的共同第一作者 。 该研究获得国家自然科学基金、北京大学临床医学+X青年专项基金和北京大学第三医院临床重点项目基金资助 。
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刘忠军教授团队证明光功能化技术对3D打印多孔钛合金假体的促成骨改性作用
2022年1月 , 北医三院刘忠军教授团队在Materials science, Biomaterials(生物材料科学)领域排名第一的 Bioactive Materials 杂志正式出版了题为“Surface treatment of 3D printed porous Ti6Al4V implants by ultraviolet photofunctionalization for improved osseointegration”的论著 , 证明了光功能化技术对3D打印多孔钛合金假体表面的促成骨改性作用 , 为将来光功能化技术在骨骼修复融合领域的应用提供了理论依据 。
3D打印多孔钛合金内植物在骨缺损修复重建中的重要作用已得到临床验证 , 但鉴于钛合金的金属惰性 , 其骨整合性能仍有待进一步提高 。 表面改性或可增加钛合金内植物的骨整合性能 , 但目前尚缺乏理想的实用性改性技术 。 在复习相关文献并不断探索的基础上 , 研究团队设计了一种基于紫外(UV)光功能化的全向照射仪 , 用于3D打印多孔钛合金内植物的表面处理 , 并证实了其体外及体内促成骨作用 , 同时对相关机制进行阐述 。
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