文献领读 | TP53基因突变与抗肿瘤免疫的肿瘤类型相关性( 二 ) 【专家导读】许多研究表明T

此外，在这些癌症队列中，调查了TP53突变、p53介导的途径(细胞周期和凋亡)和抗肿瘤免疫之间的关系。此外，还比较了接受抗PD-1/PD-L1免疫治疗的两个LUAD队列(Rizvi队列和Dong队列)中TP53突变和TP53野生型癌症的免疫治疗应答率。此外，还比较了免疫治疗环境(Samstein队列)和非免疫治疗环境(TCGA队列)中TP53突变和TP53野生型癌症的总体生存(OS)预后。这项研究为癌症中TP53突变与抗肿瘤免疫之间的关系提供了新的见解。
2材料
本研究从基因组数据共享数据门户网站(https://portal.gdc.cancer.gov/)等下载数据集，分析多种癌症中P53基因突变情况及其生存预后，各癌肿突变情况如表1所示，主要涉及乳腺癌/肺腺癌/胃腺癌/结肠癌/头颈部鳞癌/肺鳞癌，大多数癌肿TP53突变型达到了50%左右。

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表1
3结果
1TP53基因突变与肿瘤免疫的相关性
研究发现在BRCA和LUAD中，免疫特征(CD8+T细胞、NK细胞和免疫细胞溶解活性)在TP53突变的癌症中显示出显著高于TP53野生型癌症的富集水平(图1A) 。然而，在STAD、COAD和HNSC中，几乎所有这些免疫特征在TP53突变的癌症中的富集水平都显著低于TP53野生型癌症(图1A) 。
此外，在BRCA和LUAD中， TP53突变的癌症往往具有比TP53野生型癌症更高的免疫刺激信号/免疫抑制信号(CD8+/CD4+调节性T细胞、促炎/抗炎细胞因子和M1/M2巨噬细胞)(图1B) 。相反，在STAD、COAD和HNSC中，这些比率在TP53突变的癌症中比在TP53野生型癌症中更有可能更低(图1B) 。
总之，这些结果表明TP53突变与肿瘤免疫的相关性取决于癌症类型。我们还发现，在BRCA和LUAD中，相对于TP53野生型癌症，许多人类白细胞抗原(HLA)基因在TP53突变的癌症中显著上调(图1C) 。相反，在STAD、COAD和HNSC中，许多HLA基因在TP53突变的癌症中显著下调(图1C) 。这些结果再次表明TP53突变与肿瘤免疫之间的相关性与癌症类型有关。
研究比较了5种癌症类型中TP53突变和TP53野生型癌症中七种免疫相关通路的富集水平。发现所有这些免疫相关途径在TP53突变的BRCA癌症中都高度富集(图1D) 。相反，在STAD和HNSC中，所有这些免疫相关通路在TP53野生型癌症中都高度富集(图1D) 。在LUAD中， 5条免疫相关通路在TP53突变癌中有较高的富集水平，在COAD中，有3条免疫相关通路在TP53野生型癌中有较高的富集水平。总之，这些结果证实了在BRCA和LUAD中， TP53突变与抗肿瘤免疫增强有关，而在STAD、COAD和HNSC中， TP53突变与抗肿瘤免疫降低有关。

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图1
2TMB、TAL与TP53基因突变的相关性研究
研究比较了5个TCGA癌症队列中TP53突变和TP53野生型癌症的TMB和TAL 。正如预期的那样，除COAD中TP53突变的TMB低于TP53野生型外，其他癌肿TP53突变的TMB和TAL均显著高于TP53野生型(图2) 。 TMB和TAL升高可能与TP53突变癌染色体、基因组不稳定性增加有关。
有趣的是，研究发现， BRCA和LUAD的TP53突变和TP53野生型癌症之间的TMB差异比TAL要明显得多，而TAL的差异在STAD和COAD中要明显得多(图2) 。这些结果表明， TP53突变引起的TMB和TAL的改变程度取决于细胞环境，这支持了p53的作用和调节是依赖于环境的概念。

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图2