妊娠期甲亢可选择的药物有：甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶。
由于甲巯咪唑有致胎儿发育畸形的风险，因此在孕早期（妊娠前12周），优先选择丙硫氧嘧啶。由于丙硫氧嘧啶可能引起肝脏损害，甚至导致急性肝脏衰竭，因此在孕中晚期（12周以后）应优先选择甲巯咪唑。我国推荐的起始剂量为：甲巯咪唑5～15mg/d，分两次服用，或者丙硫氧嘧啶50～300mg/d，分三次服用。
妊娠期甲减首选左甲状腺素钠片。推荐起始剂量为25～50μg/d，每日一次。因妊娠期母体和胎儿对甲状腺激素的需求增加，一旦发现怀孕，应立即增加左甲状腺素钠片的剂量，最简单的方法是每周额外增加2天的剂量。
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