检测|注意！艾滋患者中出现了新型SARS-CoV-2变种！刺突|研究|艾滋|患者|变种|抗体

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红枫湾APP：一项在预印本平台上发表的研究，对三名艾滋患者中出现的新型SARS-CoV-2变种进行了分析。
发表在预印本平台medRxiv上的一项新研究，对三名艾滋患者中的新型SARS-CoV-2变种进行了分析。预印本是指研究成果还未在正式学术期刊上发表，但出于同行交流目的，通过互联网发布的科研论文。
研究背景
时至今日，新冠在全球感染了3.5亿多人，造成559万人死亡。广泛接种新冠疫苗，可实现群体免疫，并结束新冠疫情。但许多地区的疫苗供应有短缺或推迟，再加上有人对疫苗表示怀疑，所以出现了很多新冠病毒变种，这些变种病毒有更高的传播性和规避人体免疫系统的能力。
【检测|注意！艾滋患者中出现了新型SARS-CoV-2变种！】这些变种病毒让疫情不断反复，导致了新发感染、再次感染和突破性感染。
由于免疫缺陷患者无法完全清除新冠病毒，所以新冠会在体内长期存在，并让病毒基因组发生变化，适应对病毒来说有危险环境，比如适应用于治疗的抗体。
刺突基因突变，会导致刺突蛋白改变，从而修改抗体表位，进而通过抗刺突抗体，阻止或削弱刺突结合。所以中和抗体无法对这些新病毒变种起作用。
许多新冠病毒变种，包括Alpha、Beta、德尔塔（Delta）和奥密克戎（Omicron），都有多个能让它们逃避中和抗体的刺突突变。
这项预印本研究对在三名艾滋患者身上发现的新突变进行了分析。
研究发现
第一位患者入院时，有呼吸困难、体重减轻、发烧、盗汗症状。鼻咽拭子(CNTS)联合聚合酶链反应(PCR)检测为新冠阳性，患者同时还感染了HIV-1和粟粒型肺结核。患者接受了所有治疗，并在两个月后出院。再次CNTS检测显示新冠阴性。
第二位已感染HIV-1的患者之前有弥漫性大B细胞淋巴瘤，因尿路感染入院。这名患者首次确诊艾滋感染时在20年前，患者对抗病毒疗法的依从性很差。入院四周后，新冠监测呈阳性。患者因呼吸困难而需要吸氧，并在此后一直为新冠阳性。
第三位患者10年前感染了HIV-1 ，抗病毒治疗有过中断。入院时确诊为新冠感染，症状为咳嗽、发热、肌痛。尽管这些症状很快消退了，但每周的新冠检测仍呈阳性。
所有患者样本均可从CNTS检测中获得大量病毒RNA ，其周期阈值(Ct)为30 ，被认为是中高病毒载量。
在所有病例中，感染变异都是Alpha SARS-CoV-2 ，它由一个N501Y突变组成，该突变将病毒受体结合域(RBD) ，对宿主细胞血管紧张素转换酶2 (ACE2)受体的结合亲和力，提高了10倍。
当通过下一代测序(NGS)对这些患者的病毒RNA进行测序时，检测到新冠刺突RBD中有大量突变。其中一些突变没有继续，可能是因为它们被早期毒株的抗体克制。
所有患者样本，都被发现在RBD的受体结合基元(RBM)内的E484位点有突变，这是一个著名的免疫逃逸位置。其中一些突变，如E484K和E484G ，也增加了RBD对ACE2的结合亲和力。
在第三例患者的血清中，抗刺突抗体达到了可检测水平，但没有发现野生型病毒的活性。第三例患者成功分离了病毒。
研究意义
这项研究证明了新冠病毒会在有免疫缺陷的宿主体内进化，随着时间的推移，病毒会通过新的突变来适应环境。部分(不是全部)突变的持续存在表明：免疫缺陷会让人体无法将病毒清除，病毒会继续在患者体内复制。