王牌“神探”，寻找感染真相( 二 )

于是，确定病原体成为当务之急。如何又准又快地找出致病元凶？卓超想到了mNGS ，当天下午5点，病人标本被送去检测，第二天凌晨3点，结果就出来了，如卓超所料，病人感染的是淡水鱼中常见的一种细菌——“维氏气单胞菌” ，虽然毒性也大，但不及“创伤弧菌”致命。
这个结果为患者的保手治疗争取了时间，治疗对症后，患者的高热也终于控制下来，虽然两周后病人还是因为前期处理失当导致手臂血管堵死，不得不截肢，但卓超已经拼尽全力，问心无愧。
很多人可能不理解，感染性疾病的诊治，很多时候是盲人摸象式的治疗。要知道，致病的微生物有细菌、病毒、真菌、支原体、衣原体、寄生虫等，感染后引起的症候可能很相似，但治疗这些病原体的药物各不相同。
细菌是临床上患者发病最主要原因，可是细菌还分为阴性菌、阳性菌、厌氧菌等，不同的细菌往往需要不同的抗菌药，甚至一些细菌还会产生耐药性。囿于检测技术等的不足，医生很可能找不到病人感染的具体原因，只能依靠经验给予治疗，这对感染科医生的能力无疑提出了更高的要求。

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“一些疾病进展很快，传统的检测方法一时半刻得不到结果，这导致临床初始治疗可能有一些盲目性，这种盲目性带来的最直观的后果就是初始治疗药物没对路，病情可能迅速恶化，病人预后变差、住院的时间增加、整体医疗花费都会更高。 ”卓超说。
复旦大学附属华山医院抗生素研究所所长王明贵对此深有同感：“很多时候知道这个患者是细菌感染，但培养不出致病菌，临床医生拿不到证据，靠经验治疗就难免存在盲目性。 ”他补充道：“在三甲医院中，细菌性感染疾病的诊疗大约2/3都是靠经验，搞不清楚什么致病菌的情况下，很多医生倾向于选择广谱抗菌药，很多广谱抗菌药不但价格昂贵，还有多种副作用，也容易造成抗菌药滥用，导致耐药问题。 ”
王明贵不由感叹，感染性疾病的诊断，最大的问题就是病原诊断率太低。
层层迷雾中追踪真正的致病元凶，这是感染科医生的日常。
大家都知道早期诊断是防控感染性疾病的关键，但真正做到并不容易。为了找到致病元凶，医生往往会在第一时间采集患者的血液、痰液或尿液等进行培养，但是这个方法有个很大的缺点，就是慢，而且不一定有阳性培养结果。
王明贵向《新民周刊》解释：“假如患者在检测前使用广谱抗菌药，细菌将一定程度上受到抑制，极可能影响培养阳性率；第二个是传统病原微生物检测本身就存在局限；最后就是每个医疗机构检测水平的差异，微生物室的软件硬件、人员配备，实验室仪器设备等都会影响病原诊断结果。 ”
这些年，全球医疗界都在致力于感染病原学诊断水平的提高，而mNGS技术的出现，无疑是病原微生物检测领域的颠覆式创新。
传统的方法如细菌/真菌检测以培养为主，阳性率低，且耗时长，需要两三天才能出结果。而mNGS是高通量测序，可以同时测定几百万甚至上亿条DNA或RNA序列，灵敏度高， 24小时或者更短时间就可完成检测。对于新发病原体， mNGS更是优势显著。
2020年的新冠肺炎疫情中，我国科学家花了仅仅6天就完成了新冠病毒的测序工作，使用的正是mNGS技术。这和2003年SARS病毒的鉴定花了5个多月相比，无疑是一个巨大的进步，也让mNGS一战成名。