王牌“神探”,寻找感染真相( 三 )


王牌“神探”,寻找感染真相
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基因检测在武汉金银潭医院中用于检测重症患者的感染病原 。
王明贵给采访人员打了一个通俗易懂的比方:“如果说病原微生物是河里面的一条鱼 , 那么传统的微生物培养就相当于钓鱼 , 得一条一条地钓 , 效率比较低;mNGS相当于是撒网 , 大鱼小鱼都能一起捞上来 , 效率高 。 ”不过王明贵也指出 , 这些鱼中 , 真正要紧的只有一条或者几条 , 如何分辨网中鱼的属性 , 也非常重要 。 “检测数据的分析和解读水平 , 同样是这一技术应用的重点 。 ”
锁定真“凶” , 新技术变身医生王牌
据WHO统计 , 在全球 , 感染性疾病导致患者死亡占全部死因的25%以上 。 感染性疾病可累及人体各系统 , 比如呼吸系统、神经系统等 , 对于病情危重需要尽快明确病原体 , 同时传统微生物检测技术反复阴性且治疗效果不佳的病人 , mNGS技术成了医生手中的王牌 。
王牌“神探”,寻找感染真相
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浙江大学医学院附属邵逸夫医院俞云松在接受《新民周刊》采访时回忆 , 不久前 , 他接诊了一名脑膜炎患者 , 第一时间给病人安排了脑脊液样本的mNGS检测 , “脑膜炎的致病原因很多 , 不同病原所致的脑膜炎临床表现上不少病例比较类似 , 脑膜炎的病原诊断率一直比较低 。 如果是通过传统的细菌学培养 , 阳性率不到10% , 在没有获得有效的病原学证据前 , 医生通常会用广谱抗菌药先行治疗 。 这又在某种程度上导致了抗菌药的过度使用 , 因此临床上一直在寻找更好的病原体诊断技术” 。
mNGS技术出现后 , 为临床医生的诊断提供了新的技术手段 , 这个病人的检测结果出来后 , 医生很快确定这是极少见的庚型肝炎病毒引发的脑膜炎 。 知道了发病原因 , 治疗迎刃而解 。 “即便是非感染性的脑膜炎症 , mNGS检测也可以作为辅助诊断手段之一 , 检测结果阴性 , 可以帮助医生确定诊断方向 。 ”在俞云松看来 , 对于感染性疾病来说 , 精准治疗无论对改善预后还是减少病原体耐药都是非常重要的 。
俞云松还提到了mNGS在脓毒症病原诊断上的价值:“脓毒症病人通过既往的普通培养方法 , 我们拿到病原体的机会最多不超过20% 。 但结合这些新分子诊断技术 , 确诊率可提高到40%—50% , 明显提高了病原诊断率 。 ”
据重症专家的研究数据 , 我国每年脓毒症患者约568万 , 根据病情的严重程度 , 病死率可达28%—50% 。 而改善预后的关键措施之一就是及时有效的抗菌药物 , 强调应该在发病后1小时内给患者用上有效的抗菌药物 。 因此 , 俞云松希望未来mNGS技术更准、更快、更方便 。
此外 , 他所在的团队还和其他研究单位联合开展了mNGS在肺炎病原诊断率方面的研究 , 研究结果已经在“JournalofInfection”上公开发表 。 该研究发现 , mNGS检测到的微生物序列数受标本中微生物和人源细胞DNA含量双重影响 , 而去人源核酸会同时造成某些微生物序列数上升 , 某些微生物序列数下降 , 因此不建议对所有标本无差别应用 。
目前 , 在去人员核酸检测技术领域 , 已经有Q-mNGS技术 , 它实现了人源和病原体核酸的相对定量检测 , 可溯源样本中病原及人源核酸的真实比例 , 实现真/假阴性的区分和治疗效果的监测 。
其实 , 回溯mNGS最初的应用 , 就是为了解决临床上的疑难杂症 。
随着mNGS技术的发展 , 临床发现 , 对于特殊病人 , 比如早期肿瘤患者、免疫抑制宿主等 , mNGS技术也有突出效果 。
一名50多岁的男性病人 , 胸部CT显示肺部有渗出病灶 , 同时病人有发热、咳嗽、咳痰等症状 , 当地医院抗菌治疗后效果不佳 , 转到复旦大学附属华山医院抗生素研究所进一步治疗 。 “按道理说 , 社区获得性肺炎(没有住过医院 , 在医院之外得的肺炎)病原菌比较简单 , 但这个病人抗菌药换了好几轮了 , 热度还没下来 , 所以我考虑他有肿瘤的可能性 。 ”王明贵告诉采访人员 , 目前肿瘤诊断有几种办法 , 一种是肺穿刺送病理科 , 但穿刺有几个问题 , 一个是必须侵入性操作 , 有时候会引起气胸、出血等不良反应 , 病人也会紧张;另一个 , 有时候穿刺位置在肝脏、大血管壁边上 , 风险太大 。