新型冠状病毒Omicron变异株病原学及流行病学研究进展

引用本文：廖春晓,王波,吕筠,李立明.新型冠状病毒Omicron变异株病原学及流行病学研究进展[J].中华流行病学杂志,2022,43(11):1691-1698.
DOI:10.3760/cma.j.cn112338-20220929-00829

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廖春晓,王波,吕筠,李立明
摘要

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目前新型冠状病毒Omicron变异株为全球流行的优势株， Omicron变异株不断出现新的亚型，且携带更多的突变位点。与原始株和其他值得关切的变异株相比， Omicron变异株感染的致病特征和流行特征发生了明显的改变。 Omicron变异株致病性和毒性减弱，免疫逃逸能力陡增，传播速度更加迅速，更易通过物体表面和气溶胶媒介进行传播。人群感染后潜伏期缩短，无症状和轻症者居多，住院和死亡风险降低。本文重点梳理Omicron变异株的致病特征和流行特征，以期为Omicron变异株的科学防控提供参考。
【关键词】Omciron变异株；免疫逃逸；致病性；流行病学；疫苗

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前言
新型冠状病毒（新冠病毒）引发的新冠病毒肺炎（新冠肺炎）大流行仍在全球蔓延。截至2022年10月2日，全球累计感染人数超6亿，死亡人数超650万[1] 。新冠病毒持续进化和变异，先后出现Alpha（B.1.1.7）、Beta（B.1.351）、Gamma（P.1）、Delta（B.1.617.2）及Omicron（B.1.1.529）变异株。 B.1.1.529变异株最早于2021年11月在南非检出，该变异株具有大量的突变，传播速度快， WHO根据新冠病毒进化技术咨询小组的建议，将B.1.1.529列为值得关切的变异株（variantsofconcern ， VOC），并命名为Omicron变异株[2] 。 Omicron持续变异，不断出现新的亚型，主要包括BA.1 ， BA.2 ， BA.3 ， BA.4和BA.5亚型及其后代谱系。 Omicron变异株不同亚型特征的比较见表1 。本文对Omicron变异株及其亚型的病原学特点、感染的致病特征和流行病学特征及疫苗的保护效果方面进行综述，以期为Omicron变异株的科学防控提供参考。

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一、
Omicron变异株病原学特点
1.遗传变异：
Omicron（B.1.1.529）变异株来自B.1.1谱系，为新冠病毒的进化支系之一。从新冠病毒基因序列的进化树来看， BA.1、BA.2和BA.3属于Omicron变异株不同的进化分支，而BA.4和BA.5则是在BA.2的基础上进化而来，由于其遗传变异的相似性，经常把BA.4和BA.5合并称为BA.4/5[3] 。
新冠病毒入侵人体后，主要依靠其表面的刺突蛋白上的受体结合域（receptorbindingdomain ， RBD）识别宿主细胞受体血管紧张素转化酶2（angiotensinconvertingenzyme2 ， ACE2），并与之结合感染宿主细胞。刺突蛋白是唯一修饰病毒粒子表面的病毒蛋白，也是自然感染和疫苗设计的主要抗原靶标[4] 。与原始株相比， BA.1在刺突蛋白中含有34个突变，这些刺突蛋白突变会引起其病毒学特征的改变，如复制能力和毒性降低，传染力增强[5] 。随后的Omicron变异株亚型均保留这些突变。研究显示， BA.1和BA.2由于E484A和H655Y突变，导致利用跨膜丝氨酸蛋白酶2（TMPRSS2）的能力下降；S375F和H655Y突变降低了刺突蛋白介导的细胞融合性，影响病毒入侵能力从而导致其复制能力减弱[5] 。 BA.4/5与BA.2相比增加了L452R、F486V和R493Q突变，其中L452R突变是此前Delta变异株的重要突变位点，有利于病毒躲避针对RBD2类和3类区域的抗体，是导致高免疫逃逸能力的关键突变位点之一[3] 。此外， BA.4/5携带的F486V突变还有利于逃逸针对RBD的1类和2类抗体， R493Q回复突变又增加了RBD与受体结合的亲和力，进而提高了BA.4/5的适应性[3] 。