研究发现 ， 接种辐照病毒的动物的基因组RNA高度稳定 ， 而亚基因组RNA（病毒复制的指标）则降解迅速 。 我们将这些信息与从肺和肺引流纵隔淋巴结分离的细胞的单细胞RNA测序相结合 ， 并开发了新的分析方法 ， 用于在宿主对SARS-CoV-2感染的反应中无偏地靶向重要细胞 。


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左图单细胞测序揭示了肺组织中的病毒动力学；右图纵隔淋巴结单细胞测序显示炎症反应消退 。图片来源：science Translational Medicine
通过检测病毒基因组的读取 ， 我们能够确定病毒在肺部的复制似乎主要发生在肺细胞中 ， 而巨噬细胞驱动炎症反应 。 单核细胞来源的巨噬细胞被招募到肺部 ， 而不是组织驻留的肺泡巨噬细胞 ， 最有可能在感染早期对感染细胞和细胞碎片进行吞噬 ， 在清除感染过程中 ， 它们的作用会发生改变 。
总之 ， 我们的数据集提供了在轻度COVID-19过程中病毒复制和宿主反应动力学的详细视图 ， 并作为确定治疗靶点的宝贵资源 。
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