经验分享:注意!质粒中的内毒素,或可影响细胞转染效率!

转染是将外源性基因导入细胞内的一种专门技术 。 转染大致可分为物理介导、化学介导和生物介导三类途径 。 电穿孔法、显微注射和基因枪属于通过物理方法将基因导入细胞的范例;化学介导方法中脂质体转染方法较为常用;生物介导方法现在比较多见的各种病毒介导的转染技术 。
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什么是内毒素?
细菌内毒素是革兰氏阴性菌细胞壁上的一种脂多糖(LipopolySaccharide,LPS)和蛋白的复合物 , 当细菌裂解时便会大量释放出来 。 内毒素单位为EU 。
内毒素对试验的影响
内毒素存在极大程度地影响转染效率 。 同时内毒素还可能激活免疫细胞的非特异反应 , 造成实验中的假阳性 。 因此 , 为了保证高转染率和转染细胞高存活率 , 必须从质粒制备的过程中将内毒素去除 。
内毒素和质粒的关系
由于内毒素两亲性和负电荷性 , 性质类似于DNA , 因此在质粒纯化中会伴随质粒一同被纯化出来 。 质粒中内毒素含量的高低常用EU/μg质粒表示 。
按照EU/μg大小 , 质粒被分为三个级别:测序级别(>50EU/μg)、转染级别(<50EU/μg)和无内毒素级别(<0.1EU/μg) 。
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再次强调
当你提取的质粒DNA是为了转染原代细胞、悬浮细胞或者敏感细胞;进行基因沉默研究、细胞注射显微操作;进行基因治疗或者DNA疫苗等要求极为严格的实验 , 就应该考虑Endotoxin-Free的质粒 。
2017年3月 , 张锋课题组在《NatureProtocols》发表的《Genome-scaleCRISPR-Cas9knockoutandtranscriptionalactivationscreening》中 , Endotoxin-Free的质粒获得被列为CriticalStep , 同时推荐该厂家的NucleoBondEndotoxinFreePlasmidDNAkit , 可避免病毒包装和细胞培养过程中减少了内毒素残留的影响 。
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NucleoBondEndotoxinFreePlasmidDNAkit
来自有着近百年滤纸技术和近60年色谱技术的德国MN(MACHEREY-NAGEL) 。 采用阴离子交换树脂技术作为质粒纯化的原理 。
推荐原因:
内毒素低于0.05EU/ug
Endotoxin-Free系列设计有**的Endo-EF内毒素去除试剂 , 有效去除内毒素 , 避免了长时间的氯化铯超速离心步骤 , 也不需要冰上孵育30min , 内毒素含量远远低于市面上同类产品 。
得率高
采用MAE作为阴离子交换树脂填料 , 与传统的DEAE材料(二乙氨乙基)相比 , 亲水性质的羟基(-OH)替代了疏水性质的甲基(-CH3) , 更小的分子量可以使每克树脂可结合更多的质粒DNA , 得率可达1000μg 。
DEAE:Diethylaminoethyl(二乙氨乙基)
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MAE:Methylaminoethanol(甲基乙醇胺)
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超螺旋结构保护好
滤纸和色谱技术相结合诞生的NucleoBondXtraColumn实现裂解液重力过滤和过柱 , 无需离心 , 减少了离心力对质粒超螺旋结构的影响 。
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裂解后的质粒状态(泳道1)和洗脱下来的质粒状态(泳道4)是保持一致的 。
抽提速度更快
NucleoBondXtraColumn实现过滤和质粒结合树脂的步骤合二为一 , 避免较长时间的离心 。 NucleoBondFinalizer实现过柱后的溶液通过一个针管过滤器 , 质粒就可以吸附在过滤器中的介质上 , 仅需要5min即可以完成之前长达1h的异丙醇质粒离心沉淀操作!
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来源基因科技有限公司返回搜狐 , 查看更多